Una dintre realizările importante ale Serviciului Vamal a fost construcția, la sfârșitul anului 2015, a propriului Laborator vamal și dotarea acestuia cu echipamente moderne, precum și achiziția a două laboratoare mobile. Proiectul a fost finanțat în proporție de 90% din fonduri europene, iar 10% de Guvernul Republicii Moldova.
Activitatea de bază a Laboratorului este analiza fizico-chimică a mărfurilor în vederea determinării corectitudinii declarării acestora și perceperii depline a drepturilor de import. În acest scop, Laboratorul vamal este dotat cu echipamentul special, iar cele două laboratoare vamale mobile permit efectuarea rapidă a încercărilor de laborator nemijlocit în zona de control vamal.
Totodată, Laboratorul vamal efectuează instruirea funcționarilor din birourile vamale privind modul de prelevare, etichetare, sigilare, transportare, predare a probelor pentru încercări de laborator.
Subdiviziunea utilizează metode și proceduri racordate cu alte laboratoare vamale, pentru a asigura uniformitatea rezultatelor și a interpretării lor.
Laboratorul vamal a fost acreditat inițial în luna iunie 2016 de către MOLDAC, conferindu-i-se competența de efectuare a încercărilor de laborator pentru produsele petroliere și alimentare. În prezent, subdiviziunea efectuează încercări de laborator în baza a 83 metode, din care 11 – acreditate.
